BIOS METAGENÓMICA
La metagenómica se ha convertido en una de las herramientas más sofisticadas para la detección e identificación de nuevos genes, productos, vías metabólicas y metabolitos secundarios, a través de la identificación de la composición filogenética y funcional de las comunidades microbianas en diversos ecosistemas.
BIOS cuenta con la capacidad computacional, herramientas bioinformáticas y expertos para la realización de análisis exhaustivos de datos de metagenomas para inferir la composición y potencial metabólico de comunidades microbianas presentes en diferentes ambientes.
Reconstrucción de metagenoma completo
Para llevar a cabo una reconstrucción de genomas completos a partir de una muestra metagenómica, es necesario contar con robustas herramientas bioinformáticas. Un método bastante conocido denominado “binning”, es empleado, llevando a cabo un ensamblaje de cada uno de los metagenomas encontrados por medio de una clasificación de los contigs que se ensamblan.
Los flujos de trabajo o “pipelines“ para este proceo de análisis incluyen:
Análisis filogenético
El Centro de Bioinformática y Biología Computacional –BIOS cuenta con las herramientas bioinformáticas para la realización de análisis taxonómicos y funcionales asociados a:
