PROTEÓMICA

La capacidad de generar datos masivos de secuencias no se limita al ADN y ARN, también se pueden obtener datos a gran escala de proteínas

Perfiles de expresión de proteínas

A partir de nuestro análisis es posible obtener un perfil de expresión de proteínas (similar a los perfiles de expresión de RNA a partir de datos derivados de RNAseq). Por ejemplo, es posible determinar si un conjunto de proteínas de interés se encuentra expresado bajo una condición especifica, o incluso, determinar las modificaciones post-translacionales que han ocurrido.
Dependiendo del objetivo del estudio y del protocolo de obtención de la muestra, es posible determinar modificaciones tan complejas como las glicosilaciones en proteínas de membrana, o determinar la expresión del conjunto de proteínas que hayan sido fosforiladas en un tratamiento específico.

Análisis de expresión diferencial

A través del acelerado crecimiento y vertiginosa evolución que han sufrido las tecnologías ómicas, se ha revelado que una de las fuentes más grandes de información biológica sobre un organismo, tejido, o célula es reconocer el cambio en la expresión de los transcritos de los genes o sus productos proteicos finales, debido a la exposición a distintas condiciones medioambientales o a un acervo genético particular.

Los protocolos implementados en BIOS para el análisis de expresión diferencial para sets de datos proteómicos definen, qué modificaciones post-translacionales han ocurrido en las proteínas y sus valores de expresión.

Análisis de enriquecimiento de rutas metabólicas

Analizar cada uno de los genes que presentan expresión diferencial entre dos condiciones diferentes, es una tarea que puede consumir días o semanas de trabajo de un investigador, y es posible que las interacciones de co-expresión entre distintas proteínas no sean reconocidas, debido a la complejidad que posee un sistema biológico.
Los análisis de rutas metabólicas de BIOS van más allá del análisis clásico proteína-proteína, al incorporar la búsqueda de rutas metabólicas completas que puedan estar reprimidas o sobre-expresadas entre dos condiciones. Extrayendo las más recientes anotaciones de rutas metabólicas o funciones biológicas, estos análisis proveen una herramienta invaluable a la hora de entender los genes expresados o reprimidos, en una muestra en particular.