Nuestra Capacidad

HPC

La computación de alto desempeño, o HPC es la respuesta a los altos volúmenes de información que se encuentran disponible para resolver problemas complejos a los que se enfrentan las organizaciones e instituciones de hoy. Los computadores de alto desempeño como el del Centro de Bioinformática y Biología Computacional – BIOS, combinan altas capacidades y prestaciones, con el talento humano altamente especializado. En la era del Big Data es indispensable contar con una gran infraestructura de procesamiento de datos ya que esta se convierte no solo en un aliado de la investigación en Colombia; sino en un activo estratégico de interés nacional.

 

MURO DE VISUALIZACIÓN

El muro de visualización de información científica, es una de las más avanzadas herramientas de investigación científica de América Latina. Se trata de 32 pantallas full HD que juntas proveen una resolución de 66.3 megapíxeles y además puede ser controlado de 3 maneras distintas.

  • A través de una Tablet o Smartphone
  • A través de dispositivos tipo Kinnect
  • A través de una interfaz Emotiv EEG

Este proyecto fue posible gracias a la gestión de recursos del proyecto de regalías Caldas Bio-región, ejecutado por la Gobernación de Caldas, del cual BIOS es operador. Por parte del equipo investigador del Centro, en este momento se está trabajando en aplicaciones de interfaz hombre- máquina, análisis de genes mediante el uso de pipelines y flujogramas, además del análisis de imágenes médicas diagnósticas y procesos de Docking Molecular; no obstante lo anterior, los usos del muro de visualización son de amplio espectro y campos de acción. Cuenta con dos modos de operación:

  • Por medio de un servidor de vídeo para trabajo colaborativo que permite distribuir diferentes fuentes de imágenes por toda el área de visualización.
  • Conexión directa a nodos de procesamiento gráfico que permitirán hacer procesamiento y visualización de alta complejidad en tiempo real (en proceso de implementación).

 

HERRAMIENTAS BIOTECNOLÓGICAS

JBrowse

BIOS ha implementado dentro de su servidor una versión del popular visualizador de secuencias genómicas Jbrowse, con el fin de que el usuario pueda observar sus resultados de anotación de manera dinámica en una página web.

ZYFCON

En la actualidad, grandes cantidades de datos son generados a través de las nuevas tecnologías de secuenciación, y de experimentos que incluyen análisis de genes y proteínas. Sin embargo, muchos de estos datos continuan sin ser caracterizados, aun cuando la correcta anotación de las funciones enzimáticas es crítica para la reconstrucción de redes metabólicas. ZYFCON (enZYme Function prediction COmbining Networks) es una herramienta diseñada para predecir las funciones enzimáticas en sets de genes codificantes, a partir de datos de secuencia de genomas completos.

https://github.com/andquintero/ZYFCON